福船有很多优势和先进的结构，但问题是它也有自身的设计局限性，只能在甲板上安置火炮。一般都是在船尾和船头安置火炮，熟悉后世的都知道大部分后世军舰也是在这两个地方以及甲板上安置火力的。福船的船仓里有水密仓，不像欧洲的船那样有承重梁，所以就没法像欧洲的船那样船仓里放两排火炮。甚至他们有两层火炮的设置，简直是为了追求火力而丧心病狂。
当火炮的射速和威力跟不上的时候，他们这种丧心病狂的设计，反倒是比福船这种更先进的设计有优势。天津船厂生产的福船，里边的水密层横梁大量的用了铁梁，加强了一定的承重力，所以在船仓里，也能安置几门火炮，一定意义上弥补了福船火力不足的问题。不过为了承重的问题，船仓中用的火炮是膛压比较低的迫击炮，射程上有一定限制。