个刹那间，原本处在半停摆状态的研究院忽然就急速运转了起来。
而随着研究院全速运转，早已被研究院渗透影响的忍界各方势力也或是主动，或是被动的行动了起来，一层一层的命令传达下来，让大量的人员，物资开始调动，所有参与的人员都感到茫然无措，因为谁也说不清楚这一系列的调动究竟是为了什么，但命令就是命令，所有人都只能执行。
这所有的一切，只有身处研究院的真司能够清晰的感受到。
此时的忍界就好像‘活’了过来，大到各个忍村，各国大名，小到一个个黑市，一名名赏金忍者，全都在他的指令下，被动的加入到了‘壁垒计划’中...